- 2020-09-06
- 2020-12-23
MacでORTEP図を作る
ORTEP図とは X線結晶構造解析で明らかとなった分子構造を表す際に、その異方性温度因子(熱振動)をラグビーボール型の楕円体で表した分子図がORTEP図です。美しいORTEP図を出力するためのいろいろなソフトウェアが知られていますが、ここでは容易に入手可能な PLATON を使ってMac上でORTEP図を作成する方法を紹介したいと思います。
ORTEP図とは X線結晶構造解析で明らかとなった分子構造を表す際に、その異方性温度因子(熱振動)をラグビーボール型の楕円体で表した分子図がORTEP図です。美しいORTEP図を出力するためのいろいろなソフトウェアが知られていますが、ここでは容易に入手可能な PLATON を使ってMac上でORTEP図を作成する方法を紹介したいと思います。
ShelXleとは ShelXle は SHELX (特にSHELXL) を扱うためのグラフィカルなインターフェースを提供するソフトウェアです。最小二乗法による構造精密化に威力を発揮します。Mac版もあります。アカデミック用途は無料で使えます。
Macで結晶構造解析 分子の構造を知るもっとも直接的な手法の一つがX線結晶構造解析です。今や結晶構造解析は、データ解析だけなら個々人のPCで(非商用なら)無料でできるようになりました。さまざまな解析ソフトウェアがありますが、中でも最近急速に人気を伸ばしつつあるのが Olex2 です。フリーウェアであり、かつ美しい画面の Olex2 は、ありがたいことにMac版もあります。ここでは、Mac版 Ole […]