- 2020-09-06
- 2020-12-23
MacでORTEP図を作る
ORTEP図とは X線結晶構造解析で明らかとなった分子構造を表す際に、その異方性温度因子(熱振動)をラグビーボール型の楕円体で表した分子図がORTEP図です。美しいORTEP図を出力するためのいろいろなソフトウェアが知られていますが、ここでは容易に入手可能な PLATON を使ってMac上でORTEP図を作成する方法を紹介したいと思います。
ORTEP図とは X線結晶構造解析で明らかとなった分子構造を表す際に、その異方性温度因子(熱振動)をラグビーボール型の楕円体で表した分子図がORTEP図です。美しいORTEP図を出力するためのいろいろなソフトウェアが知られていますが、ここでは容易に入手可能な PLATON を使ってMac上でORTEP図を作成する方法を紹介したいと思います。
ShelXleとは ShelXle は SHELX (特にSHELXL) を扱うためのグラフィカルなインターフェースを提供するソフトウェアです。最小二乗法による構造精密化に威力を発揮します。Mac版もあります。アカデミック用途は無料で使えます。
Gitとは Gitはプログラムのソースコードなどの変更履歴を記録・追跡するための分散型バージョン管理システムです。ソースコードに限らず、電子データ全般のバージョン管理ができます。Linus Benedict Torvalds がLinuxのソースコードを管理するために作りました。複数人でのプロジェクト管理に向いていて、そのサーバーとしてメジャーなGitHub上では様々なプロジェクト管理が行われてい […]
Emacsとは Emacs というテキストエディタがあります。Vim と並んでUNIX系システムでよく使われる二大エディタの一つです。Mac版もあります。特に何も設定しなくても使える Vim とは異なり、Emacs は素の状態ではできることがかぎられていますが、設定していくと劇的に使いやすくなる “育てる系エディタ” です。Emacs はLISPという言語で設定ファイルを書 […]
松尾さんが見つけて、井上さんが知見を深め、米澤くんが育てて完成さてくれた研究成果のプレスリリースをだしました!プレスリリースは英語版の勝手がよくわからず、手間取りましたが、これでやり方がわかったので、この流れにのっていきたいと思います。 プレスリリース